链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_histogram_heatmap.html
二级分类柱状图
GO富集分析中常会有二级分类图,其横坐标代表GO三个ontology,纵坐标为基因数目,通过图可以读出基因在各GO term中的富集情况及基因数目。
OmicShare Tools中的GO分类柱状图工具,可根据上传的GO注释表进行分析及可视化,绘制成二级分类柱状图。也可以添加分组(如上下调分组)等进行可视化:
肩并肩式
堆叠式
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/osgo
堆叠图
堆叠图常见于微生物群落研究等,讲数据转化成百分比的形式,并通过堆叠柱展示出群落中物种的组成及其占比。当然,其也可用于宏基因组、转录组学等领域。
OmicShare Tools动态堆叠图工具,除了常规的纵向、横向展示,也可以将柱子“卷起来”绘制成环状堆叠图。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/reportstack.html
COG/KOG图
COG/KOG图是根据基因的COG/KOG ID或COG/KOG code绘制柱状统计图。工具可根据上传的表格,绘制出COG图或KOG图。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/cog
字母标识柱形图
字母标识柱形图,在柱形图的基础上,添加了显著性字母标记及误差棒。相同字母则表示组间无显著差异,无相同字母的组别则为差异显著。
OmicShare Tools中的字母标识柱形图工具,通过方差分析LSD多重比较的方法,进行组间差异分析。可以自由选择是否在图中呈现原始数据散点,及散点样式。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/letter_sig
两组检验柱状图
OmicShare Tools两组检验柱状图可以选择利用t-test或Wilcoxon秩和检验进行两组样本间的差异分析。在柱形图的基础上添加误差棒以及连接线。线上的*号表示显著性,如*代表两组间差异小于0.05.**代表差异小于0.01,***代表差异小于0.001,以此类推;
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/mul_groups_sig
柱形图
当然,还少不了常规柱形图工具:
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/histogram
断轴柱状图
当数据差异过大时,常会出现极高的柱子,而极低的柱子就不好进行展示了。通过纵坐标中断的“断轴”柱状图就可以解决这一问题,避免了由于数据间差距过大而导致部分数据不可读的问题,保证数据都能得到合理的展示。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/broken_columns
好啦,各式柱形图,尽在OmicShare,快来实操体验吧!
云平台工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/
成为OmicShare 年会员即可无限次免费使用大部分工具;
普通用户可以通过奥币使用工具;
如果您是新注册用户,工具有2次免费试用的机会,欢迎体验!
*未经许可,不得以任何方式复制或抄袭本篇文章之部分或全部内容。版权所有,侵权必究。
基迪奥生物|专业定制测序服务
联系方式:020-39341079;service@genedenovo.com返回搜狐,查看更多